GUI (work in progress..)
[master-thesis.git] / Parasitemia / Parasitemia / Program.fs
index bb61f4f..711ec6f 100644 (file)
@@ -4,8 +4,6 @@ open System
 open System.IO
 open System.Threading
 
-open FSharp.Collections.ParallelSeq
-
 open Emgu.CV
 open Emgu.CV.Structure
 
@@ -56,7 +54,7 @@ let main args =
 
                 factorNbPick = 1.0
 
-                darkStainLevel = 0.25 // Lower -> more sensitive. 0.3. Careful about illumination on the borders.
+                darkStainLevel = 0.25 // 0.3
                 maxDarkStainRatio = 0.1 // 10 %
 
                 infectionArea = 0.012f // 1.2 %
@@ -88,16 +86,11 @@ let main args =
             use resultFile = new StreamWriter(new FileStream(Path.Combine(output, "results.txt"), FileMode.Append, FileAccess.Write))
 
             //try
-            let images = seq { for file in files -> Path.GetFileNameWithoutExtension(FileInfo(file).Name), new Image<Bgr, byte>(file) }
+            let images = [ for file in files -> Path.GetFileNameWithoutExtension(FileInfo(file).Name), new Image<Bgr, byte>(file) ]
 
-            let nbConcurrentTaskLimit = 4
-            let n = Environment.ProcessorCount
 
             Utils.logTime "Whole analyze" (fun () ->
-                let results =
-                    images
-                    |> PSeq.map (fun (id, img) -> id, ImageAnalysis.doAnalysis img id (config.Copy()))
-                    |> PSeq.withDegreeOfParallelism (if n > nbConcurrentTaskLimit then nbConcurrentTaskLimit else n)
+                let results = ImageAnalysis.doMultipleAnalysis images config
 
                 for id, cells in results do
                     let total, infected = Utils.countCells cells