Update KdTree tests.

Use of roman number to identify images.

Merge branch 'master' of gburri.org:master-thesis

Add a benchmark test for KdTree (WIP).

Update nuget packages version.

Merge branch 'master' of gburri.org:master-thesis

Remove an useless opening directive.

FIX #277
Add some information in the GUI to see the possible command arguments.

FIX #279
A warning is displayed when the RBC diameter found do not match the image resolution.

Frame width depends now from the RBC sizes #275

Fix an error where the json files can't be created.

Update coding style.

Version 1.0.10

Define Emgu as a nuget reference for the project WPF

Micro optimization to improve analysis speed by ~20%

Update setup builder to the new Emgu dll name.

Use the Emgu library from Nuget.

Update the Logger component.

Back to .NET 4.5.2

Add some key shortcut.

Report cleaning.

Cleaning syntax.

Piaz files wasn't associated during setup.

Replace "for [..] in [..]" by "for [..] to [..]" for consistency.

Script modification for testing.

Update report.

Save predefined PPI and sensor sizes in JSON files.

Peculiar elements overlap RBC now.

Remove the removing of cells bases on standard deviation.

Change the way the dark stain is marked.

Doc + cleaning.

Update report.

Adjustment of some parameters.

Increase a bit the number of built ellipses.

More homogeneous ellipse density.

Cleaning and some little tweaks.

Update report.

Ajout de la section sur la granulometrie.

Add a DPI calculator to help to find the correct image resolution.

* Modify a bit the parasite nucleus detection sensibility.
* Add a setup.

Split the module 'ImgTools' in many modules.

Cleaning + renaming.

Add report.

Remove the parasite detection function from Ma.

Project the colors to have the best contrast for RBCs and parasites analyze.

Add a way to detect the membrane of a parasite in the ring stage.

Add some GUI elements :
- A warning if not enough erytrocytes
- The list of manually modifier erytrocytes
- Image names
- Exportation des résultats

Cleaning.

Add an option to change the brightness of the highlight box color (healthy/infected) (Can't be changed with the UI).

* Add logos CHUV and HES-SO.
* Code documentation.

Use a maybe monad to be able abort an analysis.

Force the user to input a DPI value for new image.

Add documentation.

Fix a bug during area opening/closing when the area value may become negative.

The minimum area computation wasn't correct.

Fix some approximation issues.

Add a status bar.

Add a logger assembly and split the main assembly in two : the UI and the parasitemia evaluation.

Add an about window.

* Add an exact method to compute an ellipse from three points and two tangents.
* Simplification of the matching ellipses process.

Set an application icon.

Use two radius in the configuration, one computed with the image resolution and one by granulometry.

The images to be analyzed can be selected.

Use real unit (um and ppi) instead of pixel in the parameters.

Improve readability of highlighted RBCs.

Add a way to pan from the preview.

* Add the analysis window.
* Other improvements.

* Add the possibility to set an RBC as healthy or infected

GUI (work in progress..)

GUI (work in progress..)

GUI (work in progress..)

Add the panel to display image source previews.

* Add area granulometry (not used for the moment)
* beginning of a little GUI.

* Try another approach to remove false ellipses without success (commented).
* Add otsu method in ImgTools.

Use float32 to reduce memory footprint.

Cleaning, micro-optimizations.

Cleaning.

Use float32 images instead of byte to improve the edge detection precision.

Use k-means instead of k-medians.

* Treat some special cases when ellipses intersecting.
* Some adjustments.

Simplification of the parasite marker.

Change the way the parasites are detected.

Little adjustments.

* Remove ellipses with a too high standard variation.

Cleaning.

Fix a bug in the ellipse overlap area computation.

Change the parasite detection method.

* Remove the 'DoG' filter.
* Fix the are opening.

Add functions to apply an area opening and to compute granulometry.

Fix an out-of-bound array access.

* Remove ellipses with too small area (improved).
* Draw all the ellipses in debug mode.

Improve the thinning process performance.

The main process is now complete.

Remove ellipses touching the edges.

beginning of the classifier.

Finding ellipses and parasites.

First commit of the f# source code.

Add some tests on different variations of Hough algorithm.

Logiciel de parasitémie lié au papier de Charles Ma.